1992 yılında Yaz Okulu'nun kurulmasına karar verildikten sonra Nisan 1993'te Zagreb medresesi "Dr. Ahmed Smajlović" faaliyete geçti. Zagreb medresesi, 2000 yılında Bilim, Eğitim ve Spor Bakanlığı sisteminde faaliyete geçmesiyle tanıtım hakkını elde etti. Okul Kurulu'nun inisiyatifi ile, Hırvatistan'daki İslam Cemaati Meşihat'ı, kurucu olarak, Zagreb medresesini dört seçmeli (zorunlu) dersler genel bir İslam lisesine dönüştürme kararı aldı. Arapça, Kur'an-ı Kerim, ve Kur'an ilimleri, İslam kültür ve medeniyeti, İslam din eğitimi verilen derslerin adıdır. Öğrencilerin lise eğitimini bitirdikten sonra Hırvatistan'daki ve dünyadaki tüm fakültelerde eğitimlerine devam edebilmeleri amacı bunun temel nedenidir. Haziran 2007'de Hırvatistan Cumhuriyeti Bilim, Eğitim ve Spor Bakanlığı'nın talebi üzerine Zagreb Medresesi "Dr. Ahmed Smajlović", Genel Gymnasium'un kendi plan ve programının uygulanmasını onaylayan bir karar verdi.