Cezayirli olan Muhammed bin Ali el-Senusi 1787-1859 yılları arasında Senusi tarikatını kuran, Müslüman ilahiyatçıdır. Onun kurmuş olduğu bu hareket, Libya’nın bağımsızlığını elde etmesinde çok büyük fayda göstermiştir. “Çöl Kaplanı” lakaplı Ömer Muhtar da bu harekete mensup olup, Libya’nın bulunduğu bağımsızlık savaşında Senusi hareketi ile birlikte büyük bir başarıya imza atarak 1947 yılında Libya’nın bağımsızlığını kazanmasına yardımcı olmuşlardır. Muhammed bin Ali el-Senussi’nin torunu olan İdris ise 1951 yılından 1969 yılında Muammer Kaddafi’nin kendisine darbe yapmasına kadar Libya kralı olarak kalmıştır. İslam Üniversitesi ise; 29 Ekim 1961 yılında kraliyet kararnamesiyle kurulmuştur.
Özellikle İslami İlimler alanında çalışmalar yapılması amacıyla kurulan üniversite ilk başta; Şeriat Fakültesi, Din Temelleri Fakültesi, Arap Dili Fakültesi ve Lisansüstü Çalışmalar’ı kapsamıştır.Üniversitede, şu anda Tarih ve Medeniyet, İslam Ekonomisi ve Yönetimi, Arap Dili, Din Temelleri, Şeriat ve Hukuk üzerine bölüm ve fakülteler yer almıştır. Eğitim faaliyetlerinden ayrı olarak konferanslar da düzenlenmiştir. Bunlardan bir tanesi “Libya’nın Kur’an’ı ve İlimlerini Yorumlama Çabaları” başlığı altında düzenlenmiştir. Beş ana konu üzerinden ilerlenen konferans serisinde, Kur’an-ı Kerim’in tefsiri, Kur’an ilimleri, Libya Devleti’nin Kur’an’ı ve ilimlerini yorumlama çabaları; yazmaları ve tezler ve son olarak ise Kur’an-ı Kerim ve ilimleri ile ilgili yenilikçi bir arayış üzerine olmuştur.
Ayrıca üniversitede altı adet dergi de çıkarılmıştır. Bunlar; Bilimsel Araştırma Dergisi, Bilimsel Varlıkların Dergisi, Şeriat ve Hukuk Dergisi, Al Yarubi Dilbilim, Edebiyat ve Kütüphane Çalışmaları Dergisi ile Vizyon İktisadi ve Siyasal Bilimler Dergisi’dir. Muhammed bin Ali el-Senusi İslam Üniversitesi, eğitim ve araştırma faaliyetlerine Libya’da halen devam etmektedirler. Kuzey Afrika ülkelerinde hem kuruluş itibariyle hem de sembolü olması sebebiyle bir tarihe dayalı olan üniversitesi ve sağlamaya çalıştıkları faaliyetler ile özellikle İslami ilimler alanına katkıda bulunmaya çalışmışlardır. Bu yönleriyle araştırmaya değer bulunmuş ve çalışma konusu haline gelecek derecede öneme sahip olmuştur.